Форматы данных


Для представления первичных данных в электронном виде используется принятый в НОАА "WODselect csv format", где в качестве разделителя используется запятая. Чтение данных в этом формате не требует специализированного программного обеспечения. Именно в этом формате данные представлены на DVD в папке DATABASE и данном сайте в соответствующих разделах.

Формат имеет блочную структуру, состоящую из разделов GENERAL FIELDS, представленных в таблице 1. Каждая станция начинается с ключевого слова CAST в первом столбце и её описание разделено на несколько секций. Ниже в таблицах приведено описание основных разделов CAST, METADATA, BIOLOGY METADATA, VARIABLES, BIOLOGY.

Таблица 1 - Основные секции формата "WODselect csv"
Индикатор начала секции Индикатор окончания секции Индикатор окончания секции
CAST индикатор начала следующей секции расположение и дата станции, идентификация рейса
METADATA индикатор начала следующей секции страна, судно/платформа, проект, организация, метеорология и другая информация, относящаяся к проведению измерений
VARIABLES END OF VARIABLES SECTION профиля наблюдений (если присутствует)
BIOLOGY METADATA BIOLOGY информация об отборе проб планктона (если присутствует)
BIOLOGY END OF BIOLOGY SECTION результаты наблюдения за планктоном (если присутствует)

Таблица 2 - Формат секций CAST / METADATA / BIOLOGY METADATA
Ключевое словоНазвание измеряемой переменной (пусто для полей метаданных)ЗначениеЕдиницы измерения или тип кодировкиТекстовое описание
Пример секций CAST
CAST 7550947WOD Unique StationWOD code
NODC Cruise ID GE_9629 NODC code
Пример секций METADATA
Country GEISO codeGERMANY
Ship/platform 7977WOD codeMETEOR
DatasetTemperature4WOD codeCTD: TYPE UNKNOWN
Пример секций BIOLOGY METADATA
Water_volume 23.4m3(cubic meters) 
Mesh_size 54um (micrometers) 
Gear_code 101WOD code 

Таблица 3 - Формат секции VARIABLES
VARIABLEDepthFOVariable 1FO...
UNITSm  variable 1 units  ...
Prof-Flag (entire profile) (WOD code)  (WOD code) ...
номер горизонтазначение глубины на горизонтефлаг качества горизонтафлаг качества источниказначение переменной на горизонтефлаг качества значения переменной на горизонтефлаг качества источника значения переменной на горизонте...
Пример секции "VARIABLES"
VARIABLESDepthFOTemperatureFO...
UNITSm  degrees C  ...
Prof-Flag 0  0 ...
112.23025.4467202...
230.72025.4405202...
350.80019.9403202...
Примечание F – флаг качества WOD для отдельного горизонта, O - флаг качества источника для отдельного горизонта
Таблица 4 - Формат секции BIOLOGY
Номер столбцаНазвание столбцаОписание столбцаПример
1BIOLOGYпорядковый номер записи в секции1
2Upper Zверхняя граница слоя отбора пробы, м0
3Lower Zнижняя граница слоя отбора пробы, м200
4Value Typeтип значения, указанного в столбце 5Taxon count, Wet Mass, etc.
5ORIGINAL VALUEисходное значение измерений(value)
6Fфлаг качества источника данныхWOD code
7Orig Unitисходные единицы измерения#/m2, mg/haul
8WOD CBV valueзначение после пересчета в стандартные единицы измерения(value)
9Fфлаг World Ocean Database CBVWOD code
10_unitединица измерения#/m3, mg/m3, or ml/m3
11_methметод расчетаWOD code
12WOD PGCгрупповой код планктона4212000 ( = zooplankton, crustacean, copepod)
13ITIS TSN/Nameтаксономический номер/название ITIS85272 ( = Calanus finmarchicus )
14modтаксономический модификаторWOD code ( sp., spp., ...)
15sexиндикатор полаWOD code ( male, female )
16lifиндикатор жизненной стадииWOD code (egg, larva, copepodite, ... )
17trpиндикатор трофической принадлежностиWOD code (parasitic, autotrophic, ...)
18rlmиндикатор среды обитанияWOD code (benthic, pelagic, endobiotic, ...)
19ftrформа таксонаWOD code
20spmметод определения численностиWOD code (special dyes or lighting)
21min sizeминимальный размерWOD code or mm
22max sizeмаксимальный размерWOD code or mm
23ind lengthдлина таксонаmicrons
24ind widthширина таксонаmicrons
25ind radрадиус таксонаmicrons
26tsvобъем пробыused for multi-net samplers

Более подробное описание содержится на сайте NODC
http://www.nodc.noaa.gov/OC5/SELECT/dbsearch/csv_info.html.
В таблицах используются специальные коды, которые представлены на сайте
http://www.nodc.noaa.gov/OC5/WOD09/wod_codes.html, а также размещены на DVD в папке DATABASE/WODCODES в двух форматах *.pdf и *.txt.